إن مؤسسة الزكاة تكون دوماً على استعداد لمد يد العون للمحتاجين في الحالات الطارئة والكوارث التي تستوجب الإغاثة العاجلة، مثل حدوث التسونامي أو الأعاصير أو الزلازل أو قيام الحروب أو بسبب تدني الأحوال الإقتصادية والتي يؤدي تراكمها على مر الزمن إلى إضعاف الفئات الفقيرة لأبعد حد مما يؤثر سلباً على أحوالهم المعيشية بشكل عام، وتعمل مؤسسة الزكاة من خلال مكاتبها الإقليمية المنتشرة في عدة أماكن من العالم بالسرعة المطلوبة لدرء الكوارث الطبيعية أو لمجابهة الكوارث التي يتسبب فيها الإنسان مثل الحروب، وذلك من خلال برامجها الخاصة بالإغاثة في حالات الطوارئ من أجل تلبية الاحتياجات الفورية للمتضررين من تلك الكوارث. وتقوم مؤسسة الزكاة بتوفير الإغاثة من خلال التوزيع الفوري للطرود الغذائية والأدوية